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根据上述职责，市教育局设8个职能科室。
（一）办公室
协助局领导组织协调机关日常工作，负责文秘、档案、信访、调研、保密、保卫、督办、会务、人大建议及政协提案办理、教育行政审批、机关服务中心工作。
（二）人事科
负责机关和直属单位的人事管理、机构编制工作；规划、指导全市教师队伍和教育行政干部队伍建设工作；指导学校内部人事与分配制度改革工作及教师考核工作；组织协调教育行政管理人员培训工作；指导师范类高校毕业生、毕业研究生的就业工作。
（三）计划财务科（挂审计科牌子）
会同有关部门制定全市教育事业发展规划及各类学校建设计划。参与拟订筹措教育经费、教育经费管理和教育收费的意见，监测教育经费投入、使用情况，编报市级教育经费年度预决算建议方案；管理直属学校和局机关的财务和国有资产；参与全市义务教育经费保障机制改革；协调实施全市中小学校舍安全工程；指导学生资助工作；按规定权限负责机关和直属单位的内部审计工作。
（四）基础教育科
负责全市基础教育工作（含学前教育）；推进教育教学改革，规范办学行为；拟订基础教育评估标准和有关教学、教材建设及初中学业考试、高中段招生、高中学业水平考试的有关规定；拟订各类学生平等接受义务教育、推进义务教育均衡发展的政策；指导全市特殊教育和民族教育工作；指导中小学、幼儿园的德育、校外教育和安全管理工作。
（五）职业教育与成人教育科
负责全市职业教育、成人教育和民办教育的管理工作；指导全市中等职业教育学校布局调整，负责专业设置、招生、学籍管理和毕业证书验印工作；负责市政府职业教育联席会议办公室的日常工作；指导乡镇职成教中心建设和城市社区教育工作；负责普通高校驻枣函授站的管理；协调指导民办学校布局调整、招生和管理工作。
（六）体育卫生与艺术教育科
指导全市学校体育、卫生与健康教育、艺术和国防教育工作，拟订相关政策并组织实施；制定相关专业的教材建设、师资培养和科研工作；负责全市学生体质健康调查和检测工作，拟订改善学生体质的相关政策；负责组织开展学生体育竞赛和艺术展演活动；拟订全市体育升学考试方案并指导实施；协调指导全市学校军训工作。
（七）思想政治工作与宣传科
指导全市各级各类学校的思想政治工作、德育工作和精神文明建设。指导全市教师职业道德建设及考核工作；负责全市教育系统宣传信息工作和普法宣传教育工作。
（八）师范师训科
负责全市中小学（含幼儿园）教师学历培训、校长岗位培训和继续教育工作；协调指导中等师范教育和教师进修学校的教学管理工作；负责语言文字工作；负责教师资格认定工作。
市政府教育督导室设在市教育局，由教育局代管。
离退休干部科。负责机关离退休人员的管理服务工作，指导直属单位离退休人员的管理服务工作。
